1苏州农业职业技术学院,苏州, 215008; 2苏州市农业科学院,苏州, 215008
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 3 篇
收稿日期: 2020年03月27日 接受日期: 2020年04月10日 发表日期: 2022年07月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 3 篇
收稿日期: 2020年03月27日 接受日期: 2020年04月10日 发表日期: 2022年07月18日
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摘要
本研究旨在发掘香青菜(Brassica campestris ssp. chinensis L. Makino, NHCC)中影响亚麻酸含量的相关 miRNA及其对应靶基因,探究它们的调控机制。以香青菜亚麻酸含量差异大的两个亚种‘绣花筋’和‘黑叶香青菜’的成熟叶片为材料,采用小 RNA高通量测序来鉴定两个材料中差异表达的 miRNA,预测其靶基因并进行基因功能注释。试验共鉴定得到 miRNA 236个,包括 159个已知 miRNA,77个新的 miRNA。筛选出差异表达的 miRNA 63个,其中,以‘黑叶香青菜’为对照,上调的有 28个,下调的有 35个。差异表达的miRNA对应的靶基因中共 6 041个得到功能注释,其涉及的主要通路多个与脂肪酸代谢相关,如α- 亚麻酸代谢、脂肪酸合成、不饱和脂肪酸的生物合成、脂肪酸降解等。差异表达 miRNA的靶基因主要是一些亚麻酸合成或代谢重点的关键酶,如脂氧合酶(lipoxygenase, LOX)、3- 酮酰基 -CoA硫酶 2 (3-ketoacyl-CoA thiolase,KCS)等。香青菜通过对这些 miRNA在不同品种中的差异表达负调控 LOX等脂肪酸代谢关键基因和 KCS等亚麻酸合成相关基因的表达,一方面减少亚麻酸的代谢损失,另一方面增加亚麻酸的合成量,从而引起亚麻酸含量的增高。
关键词
香青菜;亚麻酸;差异表达 miRNA;miRNA靶基因
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